Ingénieur de Recherche en Bioinformatique - Génomique Environnementale H/F - 38

Analyse de données de génomique et transcriptomique environnementale de la flore algale et fongique présente dans la neige fondante.
Activités
La personne recrutée devra finaliser les analyses de plusieurs jeux de données de métagénomique et de métatranscriptomique d'efflorescence algale des neiges. Les objectifs sont notamment de produire un catalogue des gènes de l'espèce Sanguina nivaloides.
Compétences
-Maitrise des logiciels d'analyse de séquences et du traitement des données de séquences haut débit (lectures courtes et longues).
-Maitrise des outils d'assemblage des métagénomes et métatranscriptomes.
-Maitrise de l'environnement Unix et du logiciel statistique R.
Contexte de travail

L'ingénieur travaillera dans le cadre du projet de recherche ALPALGA mené en collaboration avec l'équipe de Eric Maréchal au laboratoire Physiologie cellulaire végétale (LPCV) à Grenoble. Il s'intégrera dans l'équipe MEEBIO du Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA) sous la direction d'Eric Coissac.
L'ingénieur travaillera dans le cadre du projet de recherche ALPALGA mené en collaboration avec l'équipe de Eric Maréchal au laboratoire Physiologie cellulaire végétale (LPCV) à Grenoble. Il s'intégrera dans l'équipe MEEBIO du Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA) sous la direction d'Eric Coissac.
Contraintes et risques

Il s'agit d'un travail d'analyse de données réalisé sur ordinateur. Toutes les données sont déjà acquises, aucun risque professionnel particulier n'est à signaler.
Il s'agit d'un travail d'analyse de données réalisé sur ordinateur. Toutes les données sont déjà acquises, aucun risque professionnel particulier n'est à signaler.